Giovanni Mercante est né en 1966 à Milan. Il a étudié l'économie à l'Université Catholique du Sacré-Coeur de Milan.
Giovanni Mercante a rejoint le Groupe eni en 1992 où il a développé son expérience dans le domaine de la finance principalement sur des questions de financement de projets d'infrastructures de gaz et de fusion-acquisition.
En juillet 2003, il est devenu Directeur Financier et Administratif de Fenosa Gas SA (Madrid), société commercialisant du gaz naturel pour les clients industriels et les centrales à gaz à cycles combinés en Espagne.
En mars 2007, il a également été nommé Directeur Général en charge du back office de Segas SAE (Le Caire), société qui construit et gère le terminal de liquéfaction de gaz à Damietta Port (Egypte).
Depuis mars 2011, Giovanni Mercante est Directeur Général Adjoint Back Office d'Altergaz.